对于近红外染料Cy7和Cy7.5,市场上一般会有两种不同的结构,不同点一般在次甲基桥链上:直链次甲基桥链或者环己烯加固的桥链。前者是一种比较原始的,直接从ICG染料继承的结构,后者是优化的结构。和前者相比,后者利用环己烯结构固定次甲基桥链,结构更刚性更稳定,因此荧光量子产率提高了~20%,从而显影更灵敏。有一些文献讨论两种结构的毒性差别,据报道直链次甲基桥链Cy7和Cy7.5在小动物体内有非特异性和毒性,而桥链加固后的染料要好很多。
所有的普通Cy染料有基本相同的斯托克位移(Stokes shift),大概15nm到20nm之间。这个位移足够大(其实比很多荧光染料的斯托克位移都大,比如BODIPY系列),绝大部分荧光仪器都可以将荧光信号从激发光中分辨出来。另外,溶剂和环境对普通Cy染料的荧光特性影响很小,让它们可以胜任很多条件下的显影任务,比如在低pH溶液或者脂溶性环境下都可以发出稳定的强荧光。
为华生物CY系列荧光染料的衍生材料有:
DOPE-CY5.5 二油酰磷脂酰乙醇胺-CY5.5
DOPE-PEG-CY5 二油酰磷脂酰乙醇胺-聚乙二醇CY5
DOPE-EPG-CY3 二油酰磷脂酰乙醇胺-聚乙二醇-CY3
DOPE-EPG-CY7 二油酰磷脂酰乙醇胺-聚乙二醇-CY7
DSG-PEG2000-CY7 二硬脂酰-rac-甘油-聚乙二醇 2000-CY7
DSG-PEG-CY5二硬脂酰-rac-甘油-聚乙二醇-CY5
DSG-PEG-CY3 二硬脂酰-rac-甘油-聚乙二醇-CY3
DSG-PEG-CY5.5 二硬脂酰-rac-甘油-聚乙二醇-CY5.5
PLGA-CY7 聚(D,L-丙交酯-co-乙交酯)CY7
PLGA-PEG-cy5 CY5-聚乙二醇-聚(D,L-丙交酯-co-乙交酯)
PLGA-PEG-CY7 CY7-聚乙二醇-聚(D,L-丙交酯-co-乙交酯)
DSPE-PEG-CY5/CY5.5/CY3/CY7/CY3.5
Cy5-PEG-Silane cy5-聚乙二醇-硅
叶酸-PEG-cy3
RB-PEG-多巴胺
CY5-PEG-多巴胺
CY5.5-PEG-COOH/nh2/mal/叠氮N3
CY3/CY5.5-PEG-Mal CY3/CY5.5-聚乙二醇-马来酰亚胺
CY5/CY5.5-PEG-OPSS CY5/CY5.5-聚乙二醇-巯基吡啶