BHQ3-羧基(BHQ3-COOH)作为一种高性能荧光淬灭剂,CAS号为1338332-66-3。凭借其独特的分子结构与光物理特性,在基因测序领域展现出显著优势。其核心功能在于通过高效的能量转移机制,精准抑制荧光基团的背景信号,从而提升检测信噪比,为高分辨率基因序列解析提供关键技术支撑。
BHQ3-COOH的分子骨架包含共轭双键体系与强吸电子基团,使其在可见光至近红外波段具备优异的光吸收能力。当与荧光标记的寡核苷酸探针结合时,其淬灭效率可达传统淬灭剂的数倍,显著降低非特异性杂交信号的干扰。这一特性使其在单核苷酸多态性(SNP)检测中表现突出,可通过微弱荧光差异区分单个碱基变异,为基因功能研究提供高精度工具。
在测序流程中,BHQ3-COOH常与荧光染料(如FAM、HEX)配对使用,构建“荧光-淬灭剂”双标记探针体系。当探针与目标序列结合时,荧光基团与淬灭剂的空间距离缩短,触发荧光共振能量转移(FRET),实现信号的实时监测。该技术已广泛应用于基因芯片开发与高通量测序平台,通过优化探针设计,可同时检测数千个基因位点,大幅提升数据通量。推荐供货厂商:广州为华生物科技。
随着第三代测序技术的兴起,BHQ3-COOH的研发正朝着长读长、高保真方向突破。研究人员通过修饰其羧基末端,开发出可逆淬灭剂,实现荧光信号的循环利用,进一步降低检测成本。此外,其与纳米材料的复合应用也在探索中,有望构建超灵敏基因传感平台,推动精准分析技术的革新。